なろうのガイドラインを見てきました。

（抜粋はじめ）
小説家になろうでは二次創作の投稿を原則禁止しております。しかしながら、以下の条件にあてはまる一部の作品に関しましては、運営側で情報を確認の上、投稿を受け付ける場合がございます。
（中略）
・歴史上の人物を題材とした小説
　第二次世界大戦までの人物を目安とします。※第二次世界大戦を含む
　現在存命中の人物を題材とした作品は全面的に禁止いたします。
（抜粋おわり）

これですか？

これは、ご質問とは趣旨が違うと思いますよ。
この記述は二次創作は原則禁止とし、禁止に該当する範囲について説明しています。そして、他の作品に登場する「実在の人物」を扱うのは二次創作とは見なさないと言ってるんですよ。

歴史小説には例えば織田信長とか沖田総司とかがよく登場しますよね？　しかし、スレ主様が自作で信長を題材にしても、実在の人物ですから二次創作にはなりません。
ただし、歴史上の実在の人物であっても第二次世界大戦以降の人物は現在存命している可能性があるので登場させてはならない。

そういうことを言っているのだと思われます。

でですね。
現代日本を舞台にした戦記物であっても、スレ主様オリジナルの架空人物によるストーリーであれば、

1）二次創作

2）存命している人物が登場する

このどちらにも該当しませんから、抜粋した条項にかぎって言えば別に規約違反にはならないと考えられます。