条件が厳しすぎるような気がしました。

１．恋愛関係以外の危機
２．劣等生でなくても、極論言えば学年主席でも陥る可能性があるもの（この時点で成績関係は除外です）
３．ファンタジー要素、暴力は一切なし
４．上記の条件さえ満たしているならば危機に陥る場所は学校外でも構わない

5．それ以外ならこの際何でもええんや（ハードモード設定）
みたいな？
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学園ものとは丼物みたいなノリのもの。親子丼とか、そぼろ丼、かつ丼とか。
メインはご飯（学生）と具（テーマ）です。

閉鎖空間ゾンビ・アクションものとか、自殺した一人の生徒をめぐる疑心暗鬼ミステリー・単なる少女漫画じみた友情、不良もの、公正もの、学園のシステムそのものに関わる薄暗い物語えとせとら・・・・どんな具（テーマ）を乗っけたいのか、前提としてどんな味付け（ジャンル）にするつもりなのか、が全くない気がします。

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学園ものって、大体が一人では解決できないトラブルを学生みんなの協力で解決していく系をメインに、みんなの個人事情がぐだぐだするのがテーマの部分。

そのテーマがごっそりない上に恋愛、ファンタジー、暴力という調味料（スパイス）使用禁止とか、無茶な縛りするからキャラが動かないのでは？

その前提だと、ペルソナかて不可能やし、昔あった学園もの宇宙ライダーかて引っかかる。学園もの少女漫画やゾンビ学園ものもだめですもん。学校怪談もあかんね。

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まぁ、縦糸（テーマ）を王道の成績関係のピンチにする場合、優等生がアホ共のにわか教師役にするとかのシチュもありとは思います。

あまりに異次元レベルのアホっぷりに同じ日本語を話しているのか分からなくなり苦悩する優等生。
アホなりに優等生が自分たちをチンパンジー以下の低能と思って見下しているのを察知して反発するアホ共。

二時間かけて熟語（一つ）の意味を説明した優等生に

「は？ようは○○ってだけじゃん！？それならそうって言ってよ！！意味わかんない！！」

「あほらし、はー・・・・2時間無駄にした」

「ってか優等生って説明下手すぎて異常」

とか毒づかれて泣いてもいいんやで優等生。

「え？そんなんも分かんないレベルなの！？」

「足し算むりとかない・・・よな？」

「もういい、お前はもういいから」

「ここは猿の惑星かっ・・・」

とかディスられて自殺したくなっていいんやでアホの子。

それに端を発して、優等生が実は教師志望だったのに自信無くしちゃうとかもありだし、アホは中学校にえげつないトラブルに巻き込まれており、その当時のトラウマから授業の記憶ごとその当時の記憶を喪失していて、優等生の勉強会とともに思い出してしまい・・・とかもありっちゃありか・・・？。

この場合ごたごた友情スパルタ勉強コメディーとかかな？

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あとはキャラの長所を短所にしてトラブルにするとか。

「顔がいい」→ナルシスト、ストーカー製造機、見掛け倒し、モテすぎて同性から総スカン

とか？