>>その世界で、どうやって機械仕掛けの鎧を造る？
強力なモンスターは所謂コアのようなものを体内に持っています。
これは無限に等しいエネルギーを生み出す動力源であり意識の最小単位とも呼べるものをもつ脳でもあります。
これがある限りコア付きのモンスターは時間をかけて再生します。
これを生きたままそれなりの設備のある星（主人公の住む星では無理です）で人工的に培養するとロボットの素体が出来上がります。それに操縦席や補助AI、装甲を着させる事によってロボットが出来上がります。

>>それは要塞？それとも檻？
>>はたまた因果や理由、ルーツを失ってしまった世界とロボがいい？
この世界において地球というのは「人類が生まれたとされる伝説上の惑星」になっています。宇宙各地に散らばる「遺跡」の年代を調べると宇宙よりも前にできていることになったり、謎の多い世界です

>>ロボならある程度の整備はいるだろうし、整備には道具や場所、燃料やバックアップが要りそうだけど、どうやって捻出したい？
燃料補給や整備は重要な部分や高級な機体以外は普通に街の工場でできます。ある程度ならロボット自体が自己修復・エネルギー回復機能を持っています（元がモンスターなので）

>>怪物を、人型の機械で殺さねばならない理由は？
特に人型に拘る理由はありません。足の部分が砲になった鳥型戦闘機とか、半分獣型のロボットとか、UFOみたいな戦闘ヘリとか巨大なホバー戦車とか、色々な機動兵器があります。
人型があるのは脳波で動かすので人型の方が都合がいいのと人間の技が使える（ガンダムファイターみたいな身体能力の奴らがいる）からです。

そういった枝葉の設定はできているので、肝心の主人公機はどんな機体でどんな風に手に入れるのかを考えているところです。
遺跡の奥に眠っていたロボットを掘り起こす？
暴走した無人機をどうにか制御下において手に入れる？
野生化したロボットの前で英雄的行動をして「認められて」手懐ける？
機体によってこれらの展開が変わっていくのです。