回答ありがとうございます！
第一話目から順番に書いていて話のバランスが！というより、最初に思いついたところ（例えばキャラクターとか時代設定とか）からガチガチに固めてしまうので、その後いざ話の流れを、他のキャラを、となると噛み合わず、いたるところで矛盾が発生し……という状況に陥りやすいです。
ふわっと全体を考えるのが難しいというか、ある一点（設定・キャラ・シーン等）のために話を作ろうと思うが故に他が蔑ろになる、全体のバランスが取れなくなる傾向にあるようです。どう考えたり書いたりすれば全体の収拾がつくのでしょうか……