展開を拝読しますと、敵女Bが（少なくとも主人公と相対的に）愚か者のようにしか見えません。なぜなら、念入りに計画を立てて臨んだのに、つまり最大限に知恵を使ったのに、次々と作戦を破られちゃうわけです。

　全力を尽くしたはずの敵女Bの作戦立案がなってないとしか思えません。つまり、彼女はバカで、むしろギャグキャラの感じすらします。違和感があるとして、敵女Bのキャラの立たせ方に問題があるせいかもしれません。

　冷静で大物と設定したのに、やっていることが設定と合ってない。最後に激高することの違和感は、そこまでの流れに齟齬や矛盾がないか、見直してみる必要がありそうに思えます。

　しかし、敵女Bの作戦立案は事前情報の得方からして完璧で、推敲も手落ちなくやれていたとします。すると例えば、主人公が仲間や努力、さらに運も味方につけたことによって、奇跡的に敵に打ち勝ったとなります。そういう、うまい段取りになっている場合での違和感も考えてみます。

　不治で致死性の疾病について、告知後の患者の心理変化は、以下のようになるようです（精神科医キューベラー・ロスの研究事例）。

　否認（何かの間違いだ）
　　→怒り（なんで自分だけ）
　　　→取り引き（健康を心がければ助かるかも）
　　　　→抑うつ（もう何をしても、自分は駄目だ）
　　　　　→受容（いや、これでいいんだ。生きている間は楽しもう）

　敵女Bに適用してみますと、例えばこんな感じでしょうか。

　否認（失敗？　報告の間違いだ）
　　→怒り（あの部下がミスしたからだな！）
　　　→取り引き（自分が出張ればなんとかなるはず）
（　　→怒り2（コイツ（主人公）め、卑怯な手を使いやがって！）が入るかも）
　　　　→抑うつ（全て駄目だ、自分は奴（主人公）に勝てないんだ）
　　　　　→受容（いや、これでいい。コイツ（主人公）の強さを認めよう）

　他にも自然な流れはあると思いますので、あくまでも参考例でしかありません。ただ、もしかすると、敵女Bが激高する部分の前後で、激高するのが自然になる流れを作り損ねてないでしょうか。あるいは、激高した後の敵女B（と主人公）の言動・行動に不自然さはないか。言い換えれば、どこで激高するか、ということですね。

　それ以外の観点としては、例えば「逆鱗」があります。原義は「竜の多数ある鱗のうち、一枚だけ、触ると竜が激怒する鱗がある」です。もともとが比喩で、天子（人徳が万人を超える）の怒りの表現で、転じて目上の怒りを指します。

　しかし原義に戻り、「それを言っちゃあおしめえよ」みたいな、触れられるとどうしても不快になる、怒り出すポイントとしての「逆鱗」を考えてみます。これは敵女Bが何にプライドを持っているか、何が心のよりどころかの設定次第となります。

　どこに逆鱗があるか、すなわち、我を忘れて怒ってしまう弱点をどうするかですね。例えばですが、敵女Bが自分の頭脳に絶大な自信を持っているとします。完璧と思われた作戦が失敗したのは、ごく初歩的な知識がないためのミスのせいだった。そう主人公から明かされたら、敵女Bが（罵倒されなくても）激怒する描写は可能です（簡単ではないけど）。

　あるいは、激高が必要かどうかも再考していいかもしれません。作戦が全て水泡の泡と帰したが、敵女B自身はまだ戦えるとします。主人公を目の前にして、いったん剣を抜く敵女B。しかし、敵女Bは剣を捨て、「もういい。さっさと斬れ」と言う、なんてよくあるパターンです（そして主人公も「もういい」と言って剣を納める）。

　よくあるってことは、カッコよく締めるのがやりやすいからですね（加えて、後味もよくしやすい）。激高に違和感があれば、激高自体を再考し、例えば怒ると見えて笑ったみたいな、別の締め方を考えることも必要のように思います。