＞こういう批判モノ、アンチモノを露骨ではなくやんわりと否定批判皮肉する方法ってありますでしょうか？

単にエンタメ作品のストーリーをどうするかという話であれば、キャラ同士で激しく批判し合うことはむしろ面白くするコツの一つとも言えます。
しかし「批判モノ、アンチモノ」と仰っているところから推測するに、単なるストーリー内の衝突に留まらず、読者に対して「問題提起」をしたいという意図がおありなのかなと？

それはそれでいいのですが、書き手にそういう意識が強すぎると作中の女性批判が現実の女性批判になってしまいかねません。

＞「露骨なのは良くない」

とは、そういうことじゃないかなと。

スレ主様がガチで現実の読者と議論したいのなら止はしませんが、「やんわりと」やりたいのなら、先の書き込みで私見を述べたように、あくまで批判の対象をキャラとしての女神にとどめ、フィクションとして処理するフリをしておいた方がよいと思います。
その上で、書き手の本当の主張は伝わる人には伝わるというくらいで良いのではないかと。