三条深雪程度なら、偶然被ってしまう可能性が高いキャラ名と考えられます。なので先例の方が有名作品でなければ漢字を変えずにまったく同じでも問題ないと思います。まして、みゆき・美由紀と字を変えても問題にされるようだと創作のネーミングそのものが不可能になってしまいます。

まあ、私の場合で言うと、自作の主要キャラ名については、一応検索して先例が無いかどうか確認くらいはしています。先例が有名作で強い思い入れをもったファンがいるような場合は、何か言ってくる可能性が０とは言えませんから。
これも、そういう可能性が無くもないという程度のことですが、気にしているよりさっさと変えてしまう方が早いので、変えたこともあります。

以上は、私は一応そうしているというだけの話で、他の方に推奨はしていません。