エンタメならば読者の願望を忖度する……かなあ。

たとえＢルートが自然であっても、それを捻じ曲げてでも読者はＡルートを期待するというケースもあると思うんですね。キャラというのは読者のツボにはまると、ストーリーもコンセプトも蹴散らして無敵ですから。
また、ストーリーは自然なだけではつまらないでしょう。

で、

読者の予想は裏切れ。しかし期待は裏切るな、です。

「流れからすると、どう考えてもこれはＢルートだけど……でも、何とかＡを幸せにしてやてくれよ！」と読者に思わせることが出来れば、半分は勝ったも同然。そこに何か大技をかましてＡルートを実現できれば、読者は「よっしゃあ！」と叫んでガッツポーズしてくれます。

そんな感じがエンタメの理想形じゃないかと思うのですが。