サタン様、レスをありがとうございます。一番最初にレスをしていただいたのに返信が遅くなって申し訳ありません。

＞＞まずスレ主さんが考えるメアリー・スーの定義を教えて欲しい。

私の中のメアリー・スーの定義ですか。
私の場合だと以下の条件を複数満たすキャラクターをメアリー・スーとみなす場合が多いです。

・単純に他のキャラクターと比較して圧倒的に強い。
・ギャグテイストでもないのに作者の自己投影が余りにも強すぎる。
・（サブキャラの場合）主要キャラの出番を奪いすぎている。

といった具合です。自分でも定義が曖昧だなと思います（汗）
ヘキサ様の返信にも書きましたが、掲示したキャラの中でメアリーだったのは実は初代だけでした。
ちなみに知人の定義も私のものとそこまで逸脱していないと思います。

で、サタン様の認識に関してですが

＞＞私：「このキャラってメアリー・スーだよね（展開が主人公に都合良すぎない？）」
＞＞スレ主：「そりゃ中二病にかかり始めた頃のキャラクターだもん。自分でもメアリーと思う（こういうキャラなんだから、最強思考で当然でしょ）」
＞＞私：「うーん、まあそういう設定なのはわかるけど……」

初代については確実にサタン様の指摘通りだと思います。
初代にとって都合のいい展開は、狙撃みたいな一方的に初代を倒せる攻撃を行えるキャラクターがいないというものでした。
周囲の反応に関しても隊員からかなり持ち上げられていたので、彼は確実にメアリーだと思います。

＞＞展開や反応が「主人公や作者にとって都合が良すぎる」のは、単に作者が物語を都合のいい方向に転がしたいだけで高性能なキャラになってるので、それが透けて見えるから作者の自己満足つまりこの主人公はメアリー・スーだと私は思う。

そうですねえ……今回問題にしているベアトリクスはただ強いだけで、主人公や物語にとって都合のいい存在とは言い難いです。
強すぎてインフレを加速させるという点はむしろ物語にとって都合が悪いくらいです……
類似例みたいなのを私の中で探すと、ワンピースのエネルが該当すると思います。
エネルは武装色の覇気がない頃に登場したため、ファンからは時期尚早な強すぎるボスキャラとみなされているそうです。

ちなみに知人に後から話を聞いたところ、メアリー認定とは別の角度で強いキャラに対する問題点を指摘されました。
彼曰く「お前はどんなキャラも○○の達人という設定にしてばかりだからバランスが崩れるんだよ」とのことです。
実際に彼がメアリー認定したキャラ達は、得意分野が強すぎる傾向にあります。
初代は剣術、雄は科学技術、マルテナは射撃、ベアトリクスは軍用戦闘術全般と学業などといった風に……
彼はキャラの長所を作るにしても極端にしすぎるなと言っているみたいです。