変換後のファイルの拡張子が『.txt』となっていれば問題ありません。

　txtはプレーンテキストファイルでして、文章以外の余計なデータが入っていないので文字コードさえ合っていればOSやオフィスソフトのバージョンに関係なく閲覧できる利点があります。
　この余計なデータというのはMSワードが処理している段落行頭下げや改行といった体裁も抜けるということで一見は違って見えます。たとえば数行にわたる段落がプレーンテキストだと一行になってしまうのはこの為です。が、問題ありません。

　編集さんたちはベテランですので、当然そのプレーンテキストから本来の体裁にするとどうなるかくらいは想像できるものです。
　応募要項に規定された内容に収めたものをtxtファイルにしたのであれば、まず大丈夫でしょう。

　心配であれば、チェッカーを使ってみると良いでしょう。

原稿用紙カウンター
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ノベルチェッカー
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