『黄金の魔女フィーア』のことでしょうか？

主人公に人気がない理由についてですが、
以前、冒頭しか読んでないんですけど（マザコンキャラ登場の次のシーンくらいまで？）、
うろ覚えですが、いくつか思い当たることがありましたので書きたいと思います。

*主人公がネガティブに感じた点
個人的に気になったのは、主人公のネガティブさでしょうか。
主人公の突っ込みといえばそうなんですけど、他のキャラを少し悪く言っている印象も受けたんですよね。

あと、主人公が「ひどい」って感じるとき、誰が読んでも「これはひどい」っていうシチュがあるとバランスがいいと思うんですけど、
「黄金の魔女だ」と通りすがりの人に言われただけで、結構な文字数を使って、「嫌だ」と主人公の愚痴が書かれていたので、やられたことに対して過剰な反応だと感じられるところもありました。
たとえば、誰かに小石をぶつけられたり、あんたに売る商品はないよとか、いじわるされているなら、共感しやすいんですけど、そういうシチュがなかったように感じましたし、
「黄金の魔女」に蔑む意味も少ないので、ただ単に気に食わなくて文句を言っているようにも見えなくもないんですよね(あと、友人も魔法を使うのに彼女は恐れられていない？ところも気になりました)。
短編の合コンものでも同じような指摘を書いたような気がするんですが、読者がこれは嫌だよねって思いようなシチュを上手く書かれていないように感じたため、泣き出した女の子の方が「このくらいで泣くの？　逆に泣かれた男子可哀想」って思ってしまう原因になってました。
『黄金の魔女フィーア』でも同じように設定で「魔女として恐れられている」とあるかもしれないけど、上手く描写されていない気がしました。
こういうところが、もしかしたらキャラが立っていないと他の方に書かれたのかな？って推測しました。

*キャラ描写の比重。
他のキャラの描写を重くしているから、主人公が目立たなくなっているのでは？と思うところがありました。
冒頭の死体漁りの主人公描写はとても魅力的で、友人から依頼を引き受けて、どうなるんだろうって思っていたら、
マザコンキャラの紹介に結構な文字数を使っていたので、他の方の感想にも書かれていましたが「主人公は傍観者タイプなんでしょ？」っていう印象を与えたのでは？と思いました。

あと、主人公の置かれた立場はシリアス的に感じたけど、マザコンキャラ登場シーンはコミカルに感じたので、シリアスな冒険小説から、変わったキャラとの交流小説に変更したような感じでしたし、どちらを書きたいのか戸惑ったところもありました。
キャラ同士のコミカルな掛け合いを活かしたいのか、シリアスを書きたいのか、もうちょっとはっきりしたほうが個人的に読みやすかった気がしました。
もし、主人公のシリアス的な話を中心にしたいなら、マザコンキャラの彼のためにわざわざ登場シーンを用意せずに、冒険中にさらっと「君はすごいな。母上の次くらいには」くらいの台詞でマザコン具合を演出したほうがよかったのでは？と思いました。
逆にコミカルさを演出したいなら、主人公のネガティブさを消して、「わたし、住民に恐れられているの。死体を漁っているせいかな。てへ」くらいのノリでよかった気がしました。

*基本的にシリアスで受けるって、難しいらしい。

主人公は誤解を受けて迫害されているっぽいので、シリアス担当だと思うんですが、前述した描写で個人的に気になる点もありましたし、シリアス部分の評価がされにくかったのでは？と推測しました。
逆に他のキャラの極端な性格が評価されていたのなら、マザコンキャラ登場シーンとかコミカルに感じたので、その部分が評価されたのでは？と思いました。

スレ主様は批評サイトでも酷評を募集されていましたし、今回も主人公の魅力という技術的な点でスレを立てられていたので、何かお役に立てればと思い、
自分のことを棚上げして、色々と気になる点を書きましたが、
あくまで個人の意見ですので、合わなければ流してくださいね。
読み落とし等が原因の誤読だったら、大変申し訳ないです。

冒頭の死体漁りの主人公描写はとても魅力的でしたよ。
文章自体は読みやすかったと思います。
序盤までしか読んでいませんが、何か参考になれば幸いです。
ではでは、失礼しました。