やる夫スレについては一部ジャンルしかわからんので、思ったことをいくつか。

＞「異世界転生モノはやる夫スレ、ついでなろうが最先端で、漫画やアニメはそれの後追いに過ぎない」というような話を聞きました。
やる夫のAA紙芝居、なろう系Web小説、漫画、アニメ。
これ、作者ないし制作の労力の順だってわかりますかね？
別に「やる夫スレが最先端」なわけではないですよ。ただ作るのが一番楽なので、作者が新しい事に挑戦しやすい環境だ、ということです。
まあ、新しいものが出やすい以上は最先端だと言ってもいいかもしれませんが、挑戦者はどこにでもいるので、それこそ何かのアニメ化制作ではなくシナリオからアニメ原作で頑張ってる方々の作品は映像・アニメでしか表現できない新しい挑戦をし続けています。
しかしながら、アニメ制作はものすごい大変なので、誰も彼もが挑戦出来るわけではありませんよね。
「後追い」に見えるのは絶対数と性質の問題だと思いますよ。
アニメのやる夫AA化連載なんて二次以外で無いでしょ。

＞具体的にはどのようにそうした知識を使うのか、その使われ方に流行があると考えていますが、
知識の使い方でよくある初心者が詰まるパターンは、流れで物語を考えて「ココで敵を倒せるような科学知識は何かないか……！」と悩んで答えが出ないって考え方。
これは逆。
「その話で使う知識」は事前に決めておく。で、「その知識で倒せる」って展開にする。
我々は人間ですから、時間すなわち時系列に物事を考えやすい。
だから、過程があって結果があると考えがちだけど、それは現実世界だけのこと。
創作世界では結果があって過程を作る。
「その科学知識で敵を倒す」という結果を用意しといて、「そうなるような過程」を作る。
こうしないと、「ノリと流れで書いた物語に丁度いいミラクルフィットする知識」なんてそうそうない。
だから詰まる。

こうした知識の使われ方に、流行はないんじゃないかな。
物語のジャンルとして恋愛が流行れば「恋愛で知識を使う」し、戦闘が流行れば「戦闘で知識を使う」し、ただそれだけのこと。
使う知識やその使われ方に対して流行はないと思う。
TRPGが専門知識かどうかはわからんけど、「その手の知識」が使いたければ「その手の世界観」にしてしまうのが一番楽ってのはわかると思う。
例えば「恋愛で心理学の知識を使いたい」のであれば、「心理学に無知なヒロインと心理学に詳しい主人公が大学のゼミで出会う」とかして、そもそも「心理学」を出しやすい環境にしたほうが良い。

まあでも、いまやベタな粉塵爆発とか使いやすい知識ってものは、そりゃ当然よく使われもので、それが流行と言えなくもないとは思うけど。