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まずは物語を考えましょう。
最初は「SFらしいテーマを！」といった事は考えなくても良いです。
どんな物語か？　主人公が自分らしさを手に入れる話か？　ヒロインと恋をする話か？

で。
その手段を「SFらしいもの」にすれば良い。
自分らしさを手に入れる → 人工知能が決める管理社会から脱する
ヒロインと恋をする → 敵側のトップの女王に一目惚れされて戦争が二人の恋に振り回される → 宇宙間技術を入手したい地球と資源が欲しい王政宇宙航行国家との戦い
みたいな感じ。

そしたら、この作品で書くことは前者なら「人工知能」になるし後者なら「宇宙航行技術」になる。
なので「ソレについて」の資料を入手して勉強する。エピソードを集める。
基本はそんだけ。

量子力学が関係ない話なのにSFっぽいものを勉強しても、それを無理に披露したところで知識の押しつけにしかならず、読者側からは「作者の知識自慢がうざい」と思われかねないでしょう。
なので、書く物語を決めて、そこに必要な知識に集中し、漠然とSFっぽいものを集めたりしないほうが良い。
もちろん、SFっぽいものが好きで普段からニュートンなんかを購読してますってんならそういう趣味は否定しない。でもそれは趣味の領域であると認識すべきと思う。
シュレディンガー方程式をテーマにして何か書きたいのなら、まずは物語を考えて、その手段にシュレディンガー方程式を利用し組み立てる。
ややハードからは薄味になるけど、手段の比喩表現でSF要素を絡めるという手もある。これは比較的簡単。
例えば「シュレディンガー方程式は厳密には導出されたものではないから『発見された』と表現するのが正しい。キミがいま抱えている感情も同じだ。側面から論理的に解決させれば発見できるだろう」みたいな。
薄味にはなるけど、どんなジャンルでも使える手なので試してみると良いかもしれません。
知識は一度アウトプットすると身につきやすいので、勉強のつもりで思えたことをすぐ使ってみるのもいいと思います。

一応。
なぜ最初にSFを考えず物語を作るのかっていうと、SFにしろファンタジーにしろ、架空世界は設定の色が濃いので、これを意識すると世界観設定ばかりが増えていって話が作れないためです。
世界観は、つまり世界の設定ですから、当然のこと宇宙船があったり人工知能があったりロボットがいたり異星人も出てくるかもしれない。
すると、当たり前だけどそれらを「一つのテーマ」で括ることが出来ず、量子力学について勉強したりAIの情報技術について勉強したり、知識をはじめ考えなければならないことが非常に多岐にわたってしまいます。
そしてそれら全てを理解し正しく書こうというのは、正直無理なので、私を含め多くの人はSFは資料集めで挫折するって事が往々にしてあるわけですね。
そうならないために、最初に物語を考えて「書くべきテーマ（SF要素）」は一つに絞り、それに集中するのが良いです。

スレ主様が何をやりたいかの説明が抽象的でつかみにくいですが、一番近いのはワイドスクリーンバロックということでいいですか？
……と言ってもこの言葉はＳＦマニアをかなりこじらせた用語で（笑）、ちゃんとした定義があるのかどうか不明です。

一応。
「ワイドスクリーン」は宇宙的スケール、「バロック（語源は歪んだ真珠）」は「過剰な表現力で受け手を幻惑するような作風」という意味だと考えられますが、そういう解釈でよろしいでしょうか？

『万物理論』は読んだことがないので判りませんが、『2001年宇宙の旅』は「宇宙の遥か彼方から飛来した存在の干渉による人類の進化」というヴィジョンが「ワイドスクリーン」的ということになると思います。ただあの映画は表現が淡々としていて、バロック（歪んだ真珠）の方の要素は薄い気もします。

そういうのって、ラノベでは少ない気もしますね。「セカイ系」というのがちょっと近いかもしれませんが。
アニメなら『エヴァンゲリオン』『キルラキル』『まどマギ』あたりはけっこうワイドスクリーンバロック的だと思います。３作とも表現が派手でエキセントリックなのが特徴。くわえて設定が凝っていて、終盤に人類の歴史や地球生命の進化に関わるヴィジョンが示されたりします。そんなイメージでいいですか？

そういった作品の場合、正確な科学知識は最重要ではありません。
『まどマギ』では魔法少女が生み出す膨大なエネルギーの原理として、「思春期の少女の希望と絶望の相転移」とか言っていましたが（笑）、言葉としてもっともらしく聞こえるだけで科学的に証明できることではないのは明らかでしょう？　ただし「相転移」という言葉自体は実際の物理学用語として使われるものなので、ある程度の知識なしに小説の文中に入れるとボロがでてしまい、もっともらしくさえなりません。

なので、書きたいジャンルだけではなく具体的な舞台設定くらいは決めた上で、それを「もっともらしく」演出するために必要な知識は何か？　という順序で考えていくことになるかと。

惑星の生態系ならモンハンやんなさい。モンハンのチームは生態系キチガイが作っていますから。
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個人的には「ゾイドワイルド」？とかいう最近やっていたゾイドのアニメにきゃーきゃーしました。

【ゾイド】って言うのが惑星「Ｚ」？に後天的に発生したらしいロボット生命体みたいな存在？なんだけど、「Ｚ」に暮らす人々は、そのゾイドを主に軍事用に使っている設定。
　軍用馬とか、掃討戦に火をつけた牛とか象を籠城中の城壁破壊に使う感じに近いかな？・・・・近代では戦車とか飛行機に変わったけれど、惑星「Ｚ」のゾイドたちは「機械」だから、そのまま足や運搬力、殺傷力としてフル活用されています。

　ゾイドを殺せば食用部位こそないけれど金属や燃料が手に入るっぽいから、エネルギー問題とゾイドが持つ殺傷兵器は十分存在する、
「食料は少ないけれど、殺しあう準備は万端だぜ☆」って世界感。
なんかポスト・アポカリプスという世界感らしい。
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で、たしかゾイド・シリーズの4～5作目に当たるのが「ゾイド・ワイルド」なんですが・・・・・ゾイドたちの形状が【群生相】になってきているの。

群生相って・・・要は①仲間が増えすぎてゴハンが足りなくなったから省エネ暮らしをせねば！！②体が小さく弱くなったから仲間と協力して生きねば！！という感じ。
　バッタとかで有名だけれど、群れで暮らす生き物にはこの傾向があるよ。気になったらググって！！
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もともとアニメ・シリーズの1～２あたりの『ゾイド』では惑星「Ｚ」は①砂漠に近い惑星で、②住民たちの肌には、過剰摂取した重金属か何かが痣（あざ）として発生している感じでした。③緑もほとんどない。
　④ついでにゾイド達が孤独相で全体的にずうたいがバカでかかった。一体一体が一戸建てとかビルぐらいあんのよ

で5作目くらいの「ゾイド・ワイルド」では、①③砂漠が減って緑が増えていて、さらに②登場人物たちにタトゥーが無くなっていました。④ゾイド達の大きさは車からバイクくらい。

この世代くらいから「Ｚ」の金属が無くなりつつあるんだと思う。（主人公たちの捕獲したゾイドは家くらいあるけどね）金属生命体ゾイドに優しくない環境が進行中。
それもあってか、「Ｚ」の住人たちは旧キャラ達より背が伸びている印象。

恐竜類が鳥とかのコンパク化することを選んだように、ネズミサイズしかなかった哺乳類がだんだん巨大化し始めた時代―———古第三紀くらい？の状態っぽい

だから今世のゾイド達は一体一体がコンパクト。主人公たちは発掘に近いノリで冬眠状態にある旧世代のゾイドを狩って騎獣にしている設定でした。
（この世界のゾイドという生き物はかなり長期間の冬眠？（シャットダウン）に耐える機構らしい）

わりと生態系設定よくできてんじゃーん「ゾイド・ワイルド」
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・・・・・・みたいな話をゾイド好き（ミニ四駆よりゾイド派っだったくらい）の兄にびちゃびちゃ語ったらドン引きされたよ。(´・ω・`；)｛お、おう・・・）

正直、ｗｉｋｉれば「ゾイド」の設定とかゲボ吐くほど練られているし、記載されているぜ・・・・・・地学もミリタリーもそんな興味ないから意味わかんないけど。

そもそも、役に立つうんぬんでSF考えたら、ＳＦじたいが所詮空想だから、根本的にくだらないし、役に立てへんで？

もちろん腕時計や靴などの品物でなくても、キャラの性格を反映した特徴的な行動などでも表現できるでしょうが、いずれにしてもアニメではそういう部分を何気に目立たせる工夫をしていると思います。
演出しても視聴者に見落とされたら無意味ですから。

……まあ、コアな視聴者だけが気が付いて後でネットなどで話題にするという楽しみ方もあるにはあるかもしれませんが、ストーリーの根幹に絡む演出は見落とされるとまずいので。
なので、内容よりもむしろ「何かを気づかせて、何かを予感させる」というテクニックが重要になってくるんじゃないかと。そういう目的で目立たせることを「フラグを立てる」と言ったりします。

普通に言動でいいんじゃない？

好きな作家の作品で【金剛寺さんは面倒くさい】ってのがありますが。
男が捨て猫をみつけ「可哀想だから」とエサを与えようとしていた所で、ヒロインがそれを見つけて、こう言う

ヒ「貴様は無責任だ！！」
ヒ「行動には常に責任がともなう！！！」
ヒ「仮に貴様が猫ちゃんにエサを与えたとして、一時的なものでしかない！」
ヒ「だが、それを何の努力もなく与えられてしまった猫ちゃんはどうなる！？」
ヒ「また誰かがエサを恵んでくれることを期待してしまうのではないか？」
ヒ「イヤ期待する！！」
ヒ「生きる努力を何もせず、待ち続けてしまうに決まっているのだ！！」
ヒ「その安い同情の一口が、猫ちゃんの中にある生きる努力をスポイルしてしまうのではないか？」
ヒ「スポイルしてしまう！！」
ヒ「生きる努力の仕方を奪われてしまった猫ちゃんの猫生（じんせい）を、貴様は負えるのか？」
ヒ「責任を負えまい！！」
ヒ「貴様の自己満足に満ちたその一口を、頑張って生きている猫ちゃんに与えるな！！」

という感じ（うろ覚えです）

このセリフからヒロインのキツイ性格が、ばしばし発せられていますし、杓子定規で融通（ゆうずう）の効かなさも、「猫ちゃん」発言から猫好きなのも察せます。

この作者、絵は下手っぽいんですが、セリフ選びがキレキレで好きなんです。